STR/SSR/微卫星分析

服务编号 服务项目 内容说明 价格 周期

STR01 STR引物开发 开发未知基因组序列物种的引物 询价 2-4周

STR02 STR引物筛选 筛选适合荧光检测的引物 询价 2-4周

STR03 引物设计与合成 荧光标记引物 询价 1周

STR04 PCR条件优化 单重和多重PCR 询价 1-2周

STR05 PCR扩增 荧光或非荧光 询价 1-4周

STR06 测序仪检测 用测序仪对单色或多色荧光标记DNA片段进行分离和检测 询价 2-7工作日

STR07 原始数据分析 将原始数据分析为基因型 询价 1工作日- 2周

STR08 群体遗传学分析 关联分析、连锁图构建等 询价 1-2周

STR09 AFLP检测 检测和数据分析 询价 2-5工作日

服务项目：

1. STR引物开发

通过富集微卫星序列，开发出20-30条具有一定重复特征的微卫星序列，并且对序列进行多态性和特异性验证。

2. 引物筛选

选取部分代表性样本，利用普通引物进行PCR扩增，然后利用高分辨率芯片电泳或PAGE验证引物的特异性、扩增效率和基因座多态性等信息（图1）。

图1 用岛津MultiNA芯片电泳仪进行引物筛选的结果

3. 样本批量扩增

用带有荧光标记（FAM／HEX／TMR／ROX等）的引物，对批量样本进行PCR扩增。我公司拥有高通量PCR扩增平台，可以满足大量样本扩增需求。

4. 测序仪检测

带有荧光标记的PCR产物进行稀释后与分子量内标混合，用3730xl等测序仪进行毛细管电泳，并得到原始数据（fsa文件，见图2）。

图2 应用3730xl测序仪检测得到的原始图谱

5. 原始数据分析

编制panel和bin等文件，使用正版GeneMapper v4.0软件分析测序仪得到的fsa文件，并生成PDF图谱和Excel文档（包括size、基因分型等信息），分析后的电泳图谱见图3。

图3 GeneMapper软件分析后的电泳图谱

6. 群体遗传学分析

利用生物信息学软件（POPGENE、MEGA、PHYLIP、ARLEQUIN等）对上述数据进行进一步分析，绘制遗传连锁图谱、分析连锁不平衡和分析多态性等。

送样要求：

细胞（≥106）、组织（≥300mg）、血液（≥1ml）、基因组DNA（体积≥20μl，浓度≥ 50 ng/μl）；引物信息、片段长度范围、琼脂糖电泳图等。

提供结果：

引物、微卫星分析的原始数据以及GeneMapper生成的PDF图谱、包含片段长度等信息的Excel文档和进一步的分析结果等。

相关技术服务

服务编号 服务项目 内容说明

EXT01 DNA提取 从组织材料或血液等样本材料中提取基因组DNA，可应用液体工作站进行批量处理

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